Biologia Molecolare

L’Istituto Polidiagnostico Santa Chiara di Agropoli effettua analisi di biologia molecolare.

La biologia molecolare è una branca della biologia specializzata nello studio dei meccanismi molecolari alla base della fisiologia degli esseri viventi (DNA e RNA), tenendo conto della struttura, delle proprietà e delle reazioni delle molecole chimiche costituenti l’organismo.

La biologia molecolare ha determinato una svolta senza precedenti nella diagnostica di laboratorio. Questi sono alcuni degli esami eseguiti nel nostro Istituto.

Analisi di Paternità
Analisi di Maternità (dopo fecondazione assistita)
Analisi di Reverse Parentage (scambio in culla)
Analisi di parentela (Kinship Analysis)
Aplotipo del Cromosoma X
Aplotipo del Cromosoma Y
Aplotipo del DNA mitocondriale
Identità biologica (Confronto tra individuo e reperto bioptico o istologico)

 

Funghi

Analisi

Metodica

FamigliaGenereSpecie
PneumocystidaceaePneumocystisjirovecii (carinii)

ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

Batteri

Analisi

Metodica

FamigliaGenereSpecie
BifidobacteriaceaeGardnerellavaginalis

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

ChlamydiaceaeChlamydiatrachomatis

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

Chlamydophilapneumoniae

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

HelicobacteraceaeHelicobacterpylori

Ricerca qualitativa
Definizione patogenicità
Definizione virulenza

PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi

LegionellaceaeLegionellaspp.

Ricerca qualitativa

Real-time PCR

ListeriaceaeListeriamonocytogenes

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

MycobacteriaceaeMycobacteriumtubercolosis

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

MycoplasmataceaeMycoplasmagenitalium

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

pneumoniae

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

Ureaplasmaurealyticum

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

NeisseriaceaeNeisseriagonorrhoeae

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

Protozoi

Analisi

Metodica

FamigliaGenereSpecie
TrypanosomatidaLeishmaniaspp.

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

PlasmodiidaePlasmodiumfalciparum

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

vivax

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

SarcocystidaeToxoplasmagondii

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

Virus

Analisi

Metodica

FamigliaGenereSpecie
FlaviviridaeHepacivirusHCV – Hepatitis C Virus

Ricerca qualitativa
Ricerca quantitativa
Genotipizzazione

PCR + Elettroforesi
Real-time PCR
PCR + Elettroforesi

non assegnatoHGV – Hepatitis G Virus

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

HepadnaviridaeOrthohepadnavirusHBV – Hepatitis B Virus

Ricerca qualitativa
Ricerca quantitativa
Resistenza alla Lamivudina

PCR + Elettroforesi
Real-time PCR
PCR + Elettroforesi

HerpesviridaeAlphaherpesvirinaeHHV-1   Herpes Simplex 1   (HSV-1)
herpes simplex labiale

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

HHV-2   Herpes Simplex 2   (HSV-2)
herpes simplex genitalis

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

HHV-3   Varicella zoster virus   (VZV)

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

BetaherpesvirinaeHHV-5   Cytomegalovirus   (CMV)

Ricerca qualitativa
Ricerca quantitativa

PCR + Elettroforesi
Real-time PCR

GammaherpesvirinaeHHV-4   Epstein-Barr Virus   (EBV)

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

OrthomyxoviridaeInfluenzavirus AVirus dell’Influenza A sottotipo H1N1

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

PapillomaviridaePapillomavirusHPV – Human Papilloma Virus

Ricerca qualitativa
Genotipizzazione
Integrazione virale
Oncoproteine E6/E7

PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi

ParvoviridaeErythrovirusParvovirus B19

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

PicornaviridaeHepatovirusHAV – Hepatitis A Virus

Ricerca qualitativa

Real time PCR

RetroviridaeLentivirusHIV-1 – Human Immunodeficiency Virus

Ricerca del provirus integrato
Ricerca quantitativa
Genotipizzazione
Resistenza agli antivirali

PCR + Elettroforesi
Real-time PCR
PCR + Elettroforesi
PCR + Elettroforesi

TogaviridaeRubivirusRubella virus (virus della Rosolia)

Ricerca qualitativa

PCR + Elettroforesi

 

Patologia

Gene

Mutazione

Metodica

AutoimmunitàHLA-A; HLA-B; HLA-CTipizzazione allelicaMultiplex PCR + Reverse Dot Blot
HLA-DQA1; HLA-DQB1; HLA-DRB1PCR-SSP + CE
CeliachiaHLA-DQA1; HLA-DQB1; HLA-DRB1Aplotipi DQ2.2, DQ2.5, DQ8PCR-SSP + CE
Corea di HuntingtonHTTCAG RepeatsPCR + CE
Diabete Mellito di tipo IHLA-DQA1; HLA-DQB1; HLA-DRB1Aplotipi DR4-DQ8, DR3-DQ2, DR8-DQ4, DR15-DQ5PCR-SSP + CE
EmocromatosiHFEH63D; C282YMARMS-PCR + Elettroforesi
Emofilia BF9 (Fattore IX – Fattore di Christmas)-26G>T; -20T>C; -5A>T; T88C; 107/110delTGAA;
T111C; G112A; A116G; 118/121delTGAA; G122A;
G122C; T630G; C6347A; C6364T; G6362A; G6367C;
T6392C; A6395G; T6400A; G6410A; G6410C
6422/25delGAGA; T6442C; T6449G; C6460T;
G6461A; G6463C; G6472A; G6472C; C6488T;
G6494A; G6494T; G6494C; G20375A; C20413T;
G20414A; G20414T; G20464T; C20518T; G20519A;
G20530A; G20549A; G20562A; C20563T; 30852delC;
G30854A; A30855G; C30863T; G30864A; T30870A;
C30875T; A30897G; C30919G; C30973A; G30987A;
A31007G; C31008T; A31023T; G31028T; G31035T;
T31049T; G31053A; A31055G; C31119A; G31119C;
31071/9delGGAGATCAGinsA; G31128A; C31133T;
T31152A; 31161/3delACA; T31164G; G31203A;
T31213G; G31220A; C31223A; C31224A; C31260T;
G31262A; G31263A; G31280A; C31290T; T31344A;
31355delA		PCR + SBE + CE
Fibrosi CisticaCFTRF508del; I507del 1717-1G>A; G542X; R553X; F508C;
W1282X; I502T; N1303K; 711+1G>T; 1706del17;
1677del TA; Q552X; G85E; 621+1G>T; R117H; S549R;
R347P; 4016insT; 2183AA>G; R1158X; 2789+5G>A;
R1162X; G1244E; 3849+10kbC>T; 711+5G>A; D1152H;
L1065P; L1077P; G551D; R1066H; 4382delA; 1259insA;
852del22; T338I; S912X		PCR + SBE + CE
Studio del polimorfismo IVS8-PolyT
Studio del polimorfismo IVS8-PolyTG
>200 mutazioni + Macrodelezioni
(Del1, Del2, Del2_3, Del14b_17b,
Del17a_17b, Del17a_18, Del22_23, Del 22_24)		PCR + Sequenziamento del gene
PolicitemiaJAK2V617FARMS-PCR + Elettroforesi
Rischio cardiovascolareACE (Enzima Angiotensinogeno convertente)polimorfismo d’inserzione ALU (I/D)PCR + Elettroforesi
AGT (Angiotensinogeno)M235TPCR + SBE + CE
APOB (Apolipoproteina B)R3500QPCR + SBE + CE
APOE (Apolipoproteina E)C112R; R158CPCR + SBE + CE
CETP (Cholesteryl ester transfer protein)G153A; G279A; I405VPCR + SBE + CE
CYP7A1 (Colesterolo 7-alfa idrossilasi)-204A>CPCR + SBE + CE
Sindrome di Martin-Bell
(X – Fragile)		FMR1CGG repeatsPCR + CE
Sordità congenitaGJB231del14; 31del38; G12V; 30delG; 35delG; 35dupG;
W24X; M34T; V37I; W44C; W44X; G45E; E47X;
167delT; Q57X; 176del16; Y65X; R75Q; W77R;
W77X; 235delC		PCR + Sequenziamento
GJB6GJB6-D13S1854 macrodelezione
GJB6-D13S1830 macrodelezione		PCR + Elettroforesi
Alfa TalassemiaHBA1 (Emoglobina catena alfa)Alfa 3.7; Alfa 4.2; Alfa 20.5; MediterraneaMARMS-PCR + Elettroforesi
Beta TalassemiaHBB (Emoglobina catena beta)-101C>T; -87C>T; Codone 6(-A); HbS; HbC; IVS1-1G>A;
IVS1-6T>C; IVS1-110G>A; Codone 39C>T; IVS2-1G>A;
IVS2-745C>G; -87C>G; -88C>T; -30T>A; -29A>G;
-28A>G; Codone 1 ATG; Codone 5 (-CT); Codone 8 (-AA)
Codone 8/9 (+G); IVS-1G>C; Codone 15 G>A;
Codone 17 A>T; Codone 41/42 -TTCT		PCR + SBE + CE
Microdelezioni del Chr YCromosoma YSY84; SY86; SY127; SY134; SY138; SY139; SY220;
SY147; SY149; SY150; SY269; SY254; SY255;
YRRM1; SY158; UTY1 (AZFa); DBY1 (AZFa); DBY2		MMS-PCR + CE
Sindrome adreno-genitale
Iperplasia surrenalica congenita		CYP21A2Sequenziamento dei 10 esoni del gene
Ricerca della delezione del gene
Ricerca della chimera gene-pseudogene		PCR + CE
TrombofiliaFGB (Beta-Fibrinogeno)-455G>A
-148C>T		PCR + RFLP + Elettorforesi
F2 (Fattore II – Protrombina)G20210APCR + SBE + CE
F5 (Fattore V – Proaccelerina)R506Q (G1691A – c.1601G>A) – Variante Leiden
H1299R (A4070G – c.3980A>G) – Variante HR2
R306T (G1091C – c.1001G>C) – Variante Cambridge
Y1702C (A5279G – c.5189A>G)		PCR + SBE + CE
F7 (Fattore VII – Proconvertina)-401G>T
-402G>A
R353Q		PCR + SBE + CE
F13A1 (Fattore XIII – Fattore Fibrina stabilizzante)V34L (103G>T)PCR + SBE + CE
HPA1 o GPIIIA (ITGB3 – Integrina beta 3)1565T>C (L33P)PCR + SBE + CE
CBS (Cistationina beta sintetasi)848ins68PCR + Elettroforesi
MTHFR (Metilentetraidrofolato reduttasi)C677T
A1298C		PCR + SBE + CE
PAI-1 (Serpina1 – Inibitore dell’Attivatore del Plasminogeno)4G/5G (-675dupG)PCR + RFLP + Elettorforesi
Tumore al senoBRCA1185delAG; 5382insCMS-PCR + CE

 

Gene

Mutazione

Metodica

Recettore dell’ormone follicolo stimolante (FSHR)A307T; S680NPCR + RFLP + Elettorforesi
Recettore dell’ormone luteinizzante (LHR)I542L; C543R; C545*; R554*; D546G; A568V; M547I, A572V;
I575L; T577I; D578G; D578Y; D578E; D578H; C581R; A593P; S616Y; I625K; DeltaLV		PCR + Sequenziamento
HLA GInserzione 14 bpPCR + Elettroforesi
Inibina A (INHA)769G>APCR + RFLP + Elettroforesi
Tunel Assay (Frammentazione del DNA Spermatico) 

 

Indagine

Utilizzo

Metodica

Prostate Cancer Antigen 3 (PCA3)Marcatore tumorale del carcinoma prostaticoReal Time PCR
QF-PCR (cromosomi 13, 18, 21, X, Y)Ricerca delle più frequenti aneuploidie cromosomiche su feto (cariotipo molecolare)PCR + CE
QF-PCR (cromosomi 13, 15, 16, 18, 21, 22, X, Y)Ricerca delle più frequenti aneuploidie cromosomiche su materiale abortivoPCR + CE
QF-PCR (cromosomi 13, 18, 21, X, Y)Ricerca delle più frequenti aneuploidie cromosomiche su liquido seminalePCR + CE
Tipizzazione AB0Gruppo sanguigno A-B-OSSP-PCR + Elettroforesi
Tipizzazione RhGruppo sanguigno Rh (Antigeni C, D, E)SSP-PCR + Elettroforesi